1、制造商的選擇。
首選有實力的冷凍幹燥機廠家，且有著多年的專業生產冷凍幹燥機的經驗和專業技術、支持非標定做、解決方案。
2、冷阱溫度。
冷阱是置於凍幹腔和真空泵之間，用於捕冷凍乾燥機集蒸汽的裝置。冷阱溫度越低，冷阱的捕獲能力越強，但冷阱溫度低，對制冷要求高，機器成本及運轉費用相對也高。
上海田楓實驗室冷凍幹燥機的冷阱溫度主要有-50℃、-60℃、-80℃三個檔次。冷阱溫度為-50℃的冷凍幹燥機適用於水溶劑或者溶劑凝固點在-40℃以上的產品凍幹，冷阱溫度對捕水能力的影響實驗表明冷阱溫度從-35℃下降到-50℃，捕水能力提升明顯，冷阱溫度低於-50℃，冷阱的捕水能力提升不明顯。因此，在沒有特殊需求的情況下，選用冷阱溫度-50℃即可。冷阱溫度為-80℃左右的冷凍幹燥機適用於大部分產品如含有有機溶劑的產品凍幹或者一些特殊產品的凍幹。
3、凝冰量。
冷阱可以捕獲蒸汽的量，和實驗室每天實驗操作樣品中水或其它溶劑升華的總量有關。上海田楓實驗室冷凍幹燥機的冷阱凝冰量有3kg、6kg、8kg，適合各種不同的實驗量要求。
4、極限真空度
極限真空度體現冷凍幹燥機的泄漏情況及真空泵的抽氣效率。實驗操作的真空度應在一個合理的范圍之內，真空度太高，不利於傳熱，幹燥速度反而下降。
5、控制顯示系統
實驗室系列的冷凍幹燥機，主要應用於物料的凍幹、小批量生產和凍幹工藝條件試驗等。控制系統要具備實時顯示凍幹過程參數，如冷阱溫度、真空度、階段時間和過程總時間等;設定、修改及有效地執行凍幹工藝程序;最好具備通訊接口，便於數據采集、保存。上海田楓實驗室冷凍幹燥機系列采用的PID控制器，適用於不同實驗需求。
6、凍幹方式和功能。
根據具體的樣品，凍幹的方式亦有不同選擇。常見的實驗室凍幹實驗均采取的是Process B方式，即在凍幹腔內凍幹或者掛瓶凍幹，如果是凍幹腔凍幹即需要選購凍幹腔，需要做西林瓶凍幹還要選擇壓蓋裝置;如果是掛瓶凍冷凍乾燥機幹，則要選擇多歧管，適用於圓底燒瓶，寬口濾瓶或安瓿瓶，但要注意是否需要選擇相應的適配器來結合使用;如果用戶試驗中涉及的樣品既有腔內凍幹，也有外掛瓶凍幹的則可以選擇帶外掛口的凍幹腔。
不同的實驗、不同的樣品對冷凍幹燥機的功能要求不同，一般而言，對於食品、中草藥、粉末材料等樣品凍幹一般建議采用擱板型冷凍幹燥機;而對於西林瓶操作則必須要選擇帶壓蓋裝置的冷凍幹燥機;微生物菌種凍幹保存建議采用掛瓶式並一定要選擇安瓿瓶適配器來凍幹;如果要做凍幹工藝曲線研究的則一定要選擇控制器可支持共晶點測試裝置和軟件等工作的機型。
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